根据专利法，惠州发明专利申请流程包括受理、初审、公布、实审以及授权五个阶段。惠州实用新型或外观设计专利申请流程中不包括早期公布和实质审查，只有受理、初审和授权三个阶段。
一、受理阶段
如果惠州专利申请文件未打字、印刷或字迹模糊、有涂改；或者附图和图片不是用绘图工具和黑色墨水绘制、照片模糊和有涂改；或者惠州专利申请文件不完整；或者申请人的姓名和地址在申请书中缺失或不详；或者惠州专利申请的类别不明确或者不确定，以及没有经涉外专利代理机构的外国单位和个人直接提交的惠州专利申请，均不予受理。
二、初审阶段
惠州发明专利申请经初步审查合格的，下发初步审查合格通知书。除上述审查外，惠州实用新型专利申请和外观设计专利申请还应当审查其是否与现有专利明显相同，而不是新的技术方案或者新的外观设计，经过初步审查没有发现驳回的理由的将直接进入授权程序。
三、公开阶段
惠州发明专利申请自初审合格通知书发出之日起进入公开阶段。如果申请人未提出提前公开的请求，自申请日起满18个月进入公开准备程序。申请人要求提前公开的，惠州专利申请立即进入公开准备程序。经过格式复核、编辑校对、计算机处理、排版印刷，大约3个月后，惠州专利申请的说明书摘要在专利公报上发表，并出版说明书单行本。惠州专利申请公开后，申请人获得了临时保护权。
四、实审阶段
惠州发明专利申请在公开后，如果申请人已提出实质审查请求并已生效，惠州专利申请进入实审程序。申请人自申请日起三年内未提交实质审查请求的，或者实质审查请求未生效的，视为撤回申请。在实质审查过程中，将全面审查惠州专利申请是否具有新颖性、创造性、实用性以及专利法规定的其他实质性条件。审查后，如果认为不符合授权条件或存在各种缺陷，将通知申请人在规定时间内陈述意见或进行补正。
逾期不答复的，视为撤回申请，经多次答复仍不符合要求的，不予受理。实质审查周期很长，自申请日起两年内未获得授权的，自第三年起每年需要缴纳申请维持费。逾期未缴纳的，视为撤回申请。如果在实质审查中没有发现驳回的理由，将进入授权程序。
五、授权阶段
惠州实用新型专利申请和外观设计专利申请进行初步审查，或发明专利申请进行实质审查，未发现驳回理由的，审查员发出授权通知书，惠州专利申请进入授权登记准备阶段。在对授权文本的法律效力和完整性进行复核，对惠州专利申请的著录项目进行校对、修改后，专利局下发授权通知书和办理登记手续通知书。
申请人应当在收到通知后的2个月内办理登记手续并缴纳规定的费用。如果登记手续如期完成，专利局将授予专利权，颁发专利证书，将其记录在专利登记簿上，并于2个月后在专利公报上公布。未按要求办理登记手续的，视为放弃专利权。
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